Sekolah Menengah Pertama Islam Sidoarjo didirikan pada 5 januari 1976 dengan tanda bukti terdaftar dari kantor wilayah Departemen Pendidikan dan Kebudayaan provinsi Jawa Timur bidang pendidikan menengah umum Nomor : 1231/PMU/7610/77 yang berstatus sekolah swasta dibawah naungan Badan Penyelenggara Pendidikan Nahdlatul Ulama (BPPNU) Walisongo Sidoarjo yang terletak di jalan Pahlawan III, RW 06 Kelurahan Sidokumpul Kecamatan Sidoarjo Kabupaten Sidoarjo Provinsi Jawa Timur kode pos 61212.
Sebelum mempunyai gedung sendiri, SMP Islam Sidoarjo pernah menempati gedung Madrasah Ibtidaiyah (MINU) Kutuk Sidoarjo, setelah itu berpindah di jalan Raden Patah 78 Sidoarjo dan merjer dengan MTs NU, Aliyah NU, dan SMK Diponegoro di bawah naungan Yayasan Pendidikan Walisongo yang saat itu diketuai oleh bapak H. M. Sholichan Tahib. Dengan akte pendirian yayasan Nomor : 2 tanggal 3 September 1984 oleh Nyonya Ary Soenardjo, SH.
Pada tanggal 16 juli 2007 SMP Islam Sidoarjo menempati gedung baru di jalan Pahlawan III Sidoarjo kelurahan Sidokumpul,dengan luas tanah sekolah 2034 m2 dan luas bangunan 1332 m2. Batas kelurahan Sidokumpul yaitu sebelah utara berbatasan dengan kelurahan Magersari, sebelah timur berbatasan dengan kelurahan Gabahan, sebelah barat berbatasan dengan kelurahan Jati.
Awal memamsuki lingkungan sekolah, peserta didik dibiasakan untuk 5S (Senyum, Sapa, Salam, Salim, Santun). Kegiatan rutin setiap pagi sebelum pembelajaran adalah sholat sunnah Dhuha bersama, Pembacaan Yasin, Tahlil dan Istighotsah serta Baca Tulis Al-Qur’an sebagai bentuk implementasi peningkatan iman dan ketaqwaan kepada Allah SWT.
Kegiatan Pembelajaran berorientasi pada Pembelajaran abad 21 yang mengintegrasikan terhadap pengetahuan dan keterampilan yang berfokus pada student center dengan tujuan untuk memberikan peserta didik keterampilan berpikir kritis, memecahkan masalah, metakognisi, berkomunikasi, berkolaborasi, literasi informasi serta inovasi dan kreatif.
Sebagai penunjang pembelajaran yang nyaman, SMP Islam Sidoarjo menyediakan fasilitas yang memadai, diantaranya : Gedung Sekolah yang terletak di tengah kota dengan lokasi yang strategis serta lingkungan yang kondusif untuk mendukung kegiatan belajar mengajar dengan ruang Kelas yang nyaman, Pembelajaran menggunakan Computer Based Test, Perpustakaan, Area Wifi/Hotspot, Musholla, Koperasi Siswa, Kantin, UKS dan lain-lain.
Selain aktifitas belajar Mengajar, SMP Islam Sidoarjo mendukung peserta didik untuk berorganisasi dalam sekolah, dengan tujuan mendorong peserta didik memiliki kemampuan untuk bersosialisasi dengan peserta didik lain serta pihak terkait agar tercipta pribadi yang memiliki mental yang baik dan tangguh. Diantaranya Organisasi Intra Sekolah, Gerakan Cinta Lingkungan, dan Rohani Islam.
Untuk mengasah dan mengembangkan bakat dan minat peserta didik, SMP Islam Sidoarjo menyediakan fasilitas sebaik-baiknya kepada peserta didik untuk memilih kegiatan Ekstrakurikuler baik bersifat wajib maupun pilihan. Diantaranya adalah Pramuka, Tahfidzul Qur’an, Band, PMR, Bulutangkis, Pencak Silat, English Club, Paskibra, Basket, Sepakbola, Futsal, dan Banjari.
Kegiatan tersebut merupakan upaya agar peserta didik memiliki kemampuan Hard skill maupun Soft skill sehingga SMP Islam Sidoarjo tidak hanya menciptakan lulusan yang berprestasi dan terampil namun juga memiliki kualitas pribadi yang berkarakter, berbudi pekerti, dan religius.